中藥大生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院導(dǎo)師：方慧生 正文

　　方慧生，1989、1992年于中國(guó)人民解放軍第二軍醫(yī)大學(xué)分別獲學(xué)士、碩士，1995年于中國(guó)藥科大學(xué)獲博士學(xué)位。2000年至2002年在瑞典斯得哥爾摩大學(xué)斯得哥爾生物信息學(xué)中心從事博士后研究。爾后分別為上海生物信息技術(shù)研究中心和上海藥物研究所藥物發(fā)現(xiàn)與設(shè)計(jì)中心客座研究員。2005年至今為中國(guó)藥科大學(xué)教授。1996年獲國(guó)家技術(shù)發(fā)明三獎(jiǎng)（第二作者），2002年12月在美國(guó)召開(kāi)的CASP5會(huì)議上，在導(dǎo)師Arne Elofsson指導(dǎo)下建立的Pcons2，及與其他人合作的Pmodeller被評(píng)為最佳預(yù)測(cè)方法之一。 并在大會(huì)上作介紹（兩個(gè)專家預(yù)測(cè)方法之一）

　　講授課程（學(xué)生層次）
　　生物信息學(xué)（本科生）、藥物生物信息學(xué)（碩士生），后基因組信息學(xué)與藥學(xué)研究（博士生）、生物信息學(xué)軟件操作（博士生）

　　研究方向
　　1. 高質(zhì)量遠(yuǎn)距離同源蛋白序列比較研究
　　2. 基于蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的高質(zhì)量蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)模型研究
　　3. 基于多重序列比對(duì)的高質(zhì)量蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)模型識(shí)別研究
　　4. 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)柔性研究
　　5. 基于正則分析的蛋白質(zhì)運(yùn)動(dòng)研究
　　6. 蛋白質(zhì)-DNA連接研究
　　7. 蛋白質(zhì)代謝網(wǎng)絡(luò)研究

　　已發(fā)表文章：
　　1. Li J and Fang HS Substitution Transformation of Score Matrix for Improving Alignment Quality of Local Sequence of Distantly Related Proteins, Current Bioinformatics,2012,7,35-42
　　2.  Wallner, B., Fang, H., Ohlson, T., Frey-Skott, J. and Elofsson, A. (2004) Using evolutionary information for the query and target improves fold recognition. Proteins 54 (2) : 342-350. , Impact Factor: 3.354
　　3. Wallner,B, Fang HS and Elofsson A, Automatic Consensus-Based Fold Recognition Using Pcons,ProQ, and Pmodeller, PROTEINS,2003, 53:534–541 (2003) , Impact Factor: 3.354
　　4. Fang, H., Wallner, B. Lundström, J., von Wowern, C. and Elofsson, A. (2001) Improved fold recognition by using the Pcons consensus approach Chapter in “Protein structure prediction:Bioinformatic approach” IUL biotechnology Series, La Jolla, 1: 397-41. , Impact Factor: 2.269
　　5 方慧生等。遺忘因子法在多組分體系分析中的應(yīng)用，高等學(xué)?；瘜W(xué)學(xué)報(bào), 1994,15:518
　　6 方慧生等。遺忘因子法與其它計(jì)算方法在分光光度法中的應(yīng)用研究，分析化學(xué),1994,22:285
　　7 方慧生等。穩(wěn)健Madaline網(wǎng)絡(luò)算法及其在復(fù)方制劑分析中的應(yīng)用，分析化學(xué),1999,27:266
　　8 方慧生等。Madaline網(wǎng)絡(luò)分離重疊光譜峰及其在多組分同時(shí)分析中的應(yīng)用 分析化學(xué)，1999,27:14
　　9 方慧生等。Madaline網(wǎng)絡(luò)分離重疊光譜峰在來(lái)色體系分析中的的應(yīng)用研究 分析化學(xué)，1999,27:875
　　10 方慧生等。序列搜索算法在蛋白質(zhì)及多肽質(zhì)解譜解析中的應(yīng)用，生物化學(xué)與生物物理學(xué)進(jìn)展,1995,22:361
　　11方慧生等。多組分同時(shí)分析中單個(gè)組分的誤差傳遞原理,中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào) 1997,29:362
　　12方慧生等。分支定界法在計(jì)算機(jī)輔助質(zhì)譜解析蛋白質(zhì)序列分析中的應(yīng)用，中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào)，1994,25:177
　　13方慧生等。質(zhì)譜在蛋白質(zhì)及多肽氨基酸序列分析中的應(yīng)用，藥學(xué)進(jìn)展， 1993,17:196
　　14方慧生等。改進(jìn)Madaline學(xué)習(xí)算法預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)，中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào)，1996,27:366
　　15方慧生等。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)中的應(yīng)用，藥學(xué)進(jìn)展， 1996,20:7
　　16方慧生等。褶合光譜比值法在未知背景干擾樣品分析中的應(yīng)用，藥物學(xué)研究與展望，1999,194
　　17方慧生等。基于PCR的Madaline網(wǎng)絡(luò)算法及其在分解嚴(yán)重重疊光譜峰中的應(yīng)用，計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué)，2000,17:96
　　18方慧生等。光譜比值技術(shù)在未知背景干擾樣品分析中的應(yīng)用,計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué)，2000,17:121
　　19方慧生等。基于Kalman濾波法的Madaline網(wǎng)絡(luò)算法及其在部分未知背景干擾樣品分析中的應(yīng)用,計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué), 2000,17:122
　　20方慧生等。EME聯(lián)立方程組法在多組分分析中的應(yīng)用，光譜儀器與分析，1997,19
　　21方慧生等。復(fù)雜混合物不分離分析分析研究灰色體系的光譜學(xué)方法，光譜儀器與分析
　　22 方慧生等。蛋白質(zhì)天然構(gòu)象預(yù)測(cè)研究進(jìn)展，學(xué)，2005，36:195
　　23 方慧生等?；谡郫B識(shí)別法的蛋白質(zhì)天然構(gòu)象的一致性預(yù)測(cè)法Pcons2與聚類分析的理論探討，中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào)，2006,37:77
　　24 徐建平，方慧生，相秉仁。一種快速比較蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型相似性的方法，中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào)，2006，37:281待刊
　　25 徐建平，方慧生，相秉仁?；诔Ｓ玫梅志仃嚨纳窠?jīng)網(wǎng)絡(luò)法預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)性能的考察，中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào)，2006，37：470
　　26 彭敏,方慧生。酶功能分類與序列相似性研究進(jìn)展。國(guó)外醫(yī)學(xué)藥學(xué)分冊(cè),2006, 33(6): 452-455

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