生物信息學院成立于2000年，圍繞健康信息領域開展科學研究、人才培養(yǎng)和“產學研用”地方經濟服務。具備數字醫(yī)療儀器、醫(yī)學信息軟件、生物信息領域的本科生和研究生培養(yǎng)能力。所培養(yǎng)人才遍布在科研院所、數字醫(yī)療儀器企業(yè)、醫(yī)藥衛(wèi)生機構，具備極高的美譽度和影響力。以健康信息為特色的生物醫(yī)學工程和生物學學科在重慶和西部影響力巨大，在國內極具知名度。
學院現設有“兩系兩辦一中心”，即生物醫(yī)學工程系、生物信息系、學生工作辦公室、學院辦公室和實驗中心，擁有重慶市醫(yī)用電子與信息技術工程研究中心、生物大數據智能重慶市重點實驗室、數字醫(yī)療裝備與系統(tǒng)重慶市工程實驗室等重要科研機構，建有 “動植物基因司法鑒定中心及重慶市紅十字會救護技能培訓中心”。
依托“互聯(lián)網+”、大數據、健康中國2030規(guī)劃等重大國家戰(zhàn)略，面向智慧醫(yī)療、健康信息等產業(yè)的高速發(fā)展，秉承“創(chuàng)新驅動、精英培養(yǎng)”的理念，以“信息技術+專業(yè)”為人才培養(yǎng)優(yōu)勢，以科技創(chuàng)新素質養(yǎng)成為特色，培養(yǎng)信息技術在醫(yī)療裝備、健康信息、生物大數據等領域中應用的高級專門人才。學院建有廣獲好評的科研班、宜倫實驗班和眾創(chuàng)空間，鼓勵學生參與創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)及各類科技競賽，近年來獲中國“互聯(lián)網+”大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽等獎勵國家級50余項、省部級100余項。升學率、畢業(yè)率、授位率、就業(yè)率一直保持學校前茅。
學院擁有生物醫(yī)學工程和生物學碩士授權點，同時在兄弟學院聯(lián)合招收培養(yǎng)信息類學科博士和碩士研究生?，F有生物醫(yī)學工程、生物信息學、醫(yī)學信息工程3個本科專業(yè)，其中生物醫(yī)學工程為重慶市該領域首批“三特”專業(yè)和重慶市一流專業(yè)；生物信息學是西南地區(qū)建立最早的生物信息學專業(yè)，與美國Nicholls State University開展 “2+2”聯(lián)合培養(yǎng)，畢業(yè)生可授予中美雙學位。與美國喬治華盛頓大學合作開展3+2模式數據科學專業(yè)（MS in Data Science）碩士研究生培養(yǎng)項目。在校全日制本科生697人，全日制研究生68人。
學院現有教師59人，專任教師48人。正高級職稱13人，副高級21人，博士41人。兼職教授7名。博士/碩士研究生導師35人，?。ú浚┘壱陨先瞬?人，人才隊伍國際化和區(qū)域影響力居學校第一。北京大學原校長許智宏院士、喬治華盛頓大學曾辰教授等一批著名專家為學院特聘或外聘教授。
學院獲批建設有重慶市醫(yī)用電子與信息技術工程研究中心、重慶市數字醫(yī)療裝備與系統(tǒng)工程實驗室、生物大數據智能重點實驗室，三個類型的重慶市重點科技平臺打通了基礎研究、技術研發(fā)和產品產業(yè)化的完整鏈條。與兄弟學院共建重慶市唯一的智慧醫(yī)療系統(tǒng)與核心技術創(chuàng)新團隊。獲得6次中央與地方共建實驗室建設項目，擁有2500多萬元教學科研儀器。近年來主持和承擔了科研項目200多項，發(fā)表科研論文600余篇，出版學術專著7部，獲得國家專利100多項，國家級獎勵1項，省部級獎勵6項。
高度重視對外交流，與北京大學、清華大學、中國軍事科學院、陸軍軍醫(yī)大學，美國馬里蘭大學、喬治華盛頓大學、EBI、Nicholls州立大學、華大基因、重慶西山科技等單位在健康信息領域進行深度科技交流與合作。
學院地處鳥語花香，悠遠厚重的南部校區(qū)；全院師生努力拼搏，奮力建設一流的醫(yī)用電子與生物信息學科；形成了“健康、和諧、朝氣”的學院文化氛圍。